Durante un tragitto verso l'area portuale, Conan e Kogoro assistono a un evento drammatico: un proiettile infrange il vetro della monorotaia colpendo un passeggero. Approfittando di una sosta forzata, i due si lanciano all'inseguimento del tiratore, riuscendo a individuare l'edificio da cui è stato esploso il colpo. Giunti in un appartamento sospetto all'interno di un condominio, Conan analizza la traiettoria dello sparo e la posizione delle finestre, convinto che il cecchino si nasconda ancora tra quelle mura. Inizia così una rischiosa perlustrazione per scovare l'attentatore e scoprire se il passeggero fosse un bersaglio casuale o la vittima di un'esecuzione meticolosamente pianificata.