Dopo essersi fatti sfuggire accidentalmente un sequestratore, Sato e Takagi si lanciano in un inseguimento che li conduce nella prefettura di Kanagawa. A Yokohama, la squadra riceve il supporto dell'abile ispettrice Chihaya Hagiwara, che si unisce alla caccia all'uomo. Contemporaneamente a Tokyo, Conan e i Giovani Detective avviano le ricerche per localizzare la bambina rapita, rimasta nelle mani dei complici. Inizia una serrata operazione coordinata tra le due città: i ragazzi e la polizia devono condividere ogni minimo indizio in tempo reale per individuare il nascondiglio della piccola prima che il fuggitivo riesca a dileguarsi definitivamente e a far perdere ogni traccia dell'ostaggio.